Деревня Пустынька находится в среднем течении Онеги. В древности здесь был волок с Онеги на реку Емцу, относящуюся к бассейну Северной Двины. Этим путем пользовались древние новгородцы, которые, как известно, уже в XI веке доходили до Печоры и предгорьев Урала. К XVI веку относится самое раннее упоминание о находившемся здесь монастыре. В екатерининское время обитель была упразднена. В начале ХХ века монастырь возродился, но в годы Гражданской войны был разорен. В советское время в Пустыньке был устроен психо-неврологический интернат, который сейчас уже не существует. В настоящее время здесь осталось несколько сезонно используемых домов, постепенно разрушаются корпуса интерната. В месте, где русло реки делает излучину, стоит деревянная Благовещенская церковь. Она была построена в 1719 году, когда еще действовал монастырь. Церковь двухэтажная. Верхний Вознесенский храм был освящен в 1725 году. Позже церковь использовалась как приходская.
    Благовещенская церковь отличается необычным завершением. Оно выполнено в виде крупной бочки, так же покрыт и алтарный прируб. Венчавшая церковь глава ныне утрачена. За долгую историю своего существования храм перестраивался. Изменилось устройство трапезной на втором этаже, появилась обшивка стен, новое крыльцо. Удивительна сохранность первоначальных интерьеров. Уцелели небольшие косящатые окна, двери, потолки из досок внахлест, как делали раньше. На втором этаже в молитвенном помещении можно увидеть лавки вдоль стен, остатки клиросов, потолок – «небо», напоминающий солнце с расходящимися лучами.
    Здание давно не ремонтировалось, обветшало, но находится еще в относительно неплохом состоянии. Однако в некоторых местах на бочках начала разрушаться кровля, появились протечки и повреждения конструкций.
    В августе 2011 года было проведено обследование Благовещенской церкви. Были сделаны обмеры здания, выявлены следы перестроек. Результаты этой работы опубликованы (Бодэ А.Б., Терентьева А.А. Благовещенская церковь в деревне Пустынька. История, архитектура, характерные особенности // Архитектурное наследство. Вып. 57. М., 2012. С. 101-114). В этот же приезд были проведены некоторые первоочередные консервационные работы, нацеленные на устранение протечек кровли, и созрело решение провести посильные реставрационные работы.
    Зимой 2012 года был заготовлен материал и завезен на место с помощью местного предпринимателя А.В. Рожкова. В июне того же года была заменена тесовая кровля на полицах в основании обеих бочек. Работа проводилась онежскими плотниками В.И. Казаковым и С.В. Головченко. Закупка материалов и оплата работ производилась в основном из средств, собранных разными людьми, неравнодушными к судьбе культурного наследия Севера. Недостающую для завершения этапа сумму выделил Фонд содействия возрождению Храмов Отечества (проект «Общее дело»).
    Благовещенская церковь в Пустыньке уникальна и по своей архитектуре, и по исторической значимости места, где она находится, и что не менее важно – является памятью об одном из северорусских монастырей. Надеемся, что в будущем найдутся силы и средства для сохранения этого замечательного храма.